生物質顆粒的儲存是影響顆粒質量的關鍵因素，生物質顆粒儲存一般分為堆積式和克隆式兩種。
堆積式儲存是指將生物質顆粒放置于露天或罐內，但是有以下不足：1. 易受潮氧化。2. 儲存量有局限性。3. 易被破壞和襲擊。
克隆式儲存是采用高度自動化老化貯罐，儲存方式安1全、高1效且占用空間小，但成本較高。
在儲存時需要注意以下幾點：
儲存地點要干燥、通風
顆粒間需有一定縫隙
檢查顆粒狀態和含水率